186
DB名 IMGT
別称 The international ImMunoGeneTics information system
提供機関 Marie-Paule Lefranc of the Universite Montpellier II
提供機関の所在 (国) フランス
URL http://imgt.cines.fr/
カテゴリ タンパク質 > 機能データベース
タンパク質 > その他
提供データ 免疫グロブリン、T細胞受容体、主要組織適合(遺伝子)複合体、免疫グロブリン超分子群、主要組織適合複合体スーパーファミリー、ヒトおよび他の脊椎動物の免疫システムに関連するタンパク質に特化した知識リソース.
取り扱い生物種 ヒト、脊椎動物
提供様式 Webアプリケーションによる検索および結果の閲覧.
FTPによるデータのダウンロード.
利用条件 -
データ量 <1> IMGT/LIGM-DB
235生物種 136,575エントリー

<2> IMGT/PRIMER-DB
1,864エントリー

<3> IMGT/GENE-DB
1,999遺伝子 3,026対立遺伝子

<4> IMGT/3Dstructure-DB
1,655エントリー
(2009/06)
更新頻度 -
更新記録 -
Id 186
説明(項目なし) 免疫グロブリン、T細胞受容体、主要組織適合(遺伝子)複合体、免疫グロブリン超分子群、主要組織適合複合体スーパーファミリー、ヒトおよび他の脊椎動物の免疫システムに関連するタンパク質に特化した知識リソース.
IMGTでは次の5つのデータベースを公開している.
・配列データベース:IMGT/LIGM-DB、IMGT/MHC-DB、IMGT/PRIMER-DB
・ゲノムデータベース:IMGT/GENE-DB
・構造データベース:IMGT/3Dstructure-DB

上記のうち、IMGT/MHC-DB は EBI で公開している.
利用方法 " target="_blank">

検索インターフェース


入力例


<1> IMGT/LIGM-DB
Annotation Label Search で POLYA_SIGNAL を選択.

<2> IMGT/PRIMER-DB
IMGT/PRIMER-DB Primer accession number に IPP000201 を入力.

<3> IMGT/GENE-DB
Species で Homo sapiens を選択

<4> IMGT/3Dstructure-DB
Search by Species and Receptor or Chain (DESCRIPTION) で以下のように選択
Species:Homo sapiens
IMGT receptor type:IG

データ一括取得方法


IMGT/LIGM-DB の配列ファイル:
ftp://ftp.cines.fr/IMGT

リンクの張り方


関連データベース


関連ソフトウェア


EBI

検索インターフェース


入力例


<1> IMGT/LIGM-DB
Annotation Label Search で POLYA_SIGNAL を選択.

<2> IMGT/PRIMER-DB
IMGT/PRIMER-DB Primer accession number に IPP000201 を入力.

<3> IMGT/GENE-DB
Species で Homo sapiens を選択

<4> IMGT/3Dstructure-DB
Search by Species and Receptor or Chain (DESCRIPTION) で以下のように選択
Species:Homo sapiens
IMGT receptor type:IG

データ一括取得方法


IMGT/LIGM-DB の配列ファイル:ftp://ftp.cines.fr/IMGT

リンクの張り方


関連データベース


関連ソフトウェア


EBI
Tips -
その他 免疫グロブリン、T細胞受容体、主要組織適合(遺伝子)複合体、免疫グロブリン超分子群、主要組織適合複合体スーパーファミリー、ヒトおよび他の脊椎動物の免疫システムに関連するタンパク質に特化した知識リソース.
wingpro_id 186